Choisir ses sources
Cochez vos sources sous le champ de saisie, à chaque question. Ce guide dit ce que chacune contient, ce qui se combine et laquelle choisir.
Équipe Emerit Science
1. Les quatre sources
Charlie interroge les sources que vous cochez. Internet et Brevets se cochent d'un clic, Corpus Emerit ouvre une liste, et Mes bibliothèques dépend du nombre de bibliothèques que vous avez.
Corpus Emerit
La littérature scientifique : PubMed, HAL, bioRxiv et PMC full text. Coché par défaut.
Mes bibliothèques
Les documents que vous avez importés. Une seule bibliothèque par question pour l'instant.
Internet
Le web, dont les sites des autorités sanitaires. Décoché par défaut.
Brevets
Les brevets européens et internationaux. Offres Premium et Équipe.
- Une source au minimum. La dernière source cochée ne peut pas être retirée : « Gardez au moins une source. »
- Votre choix est repris à la session suivante, sur le même navigateur. Une source cochée le reste jusqu'à ce que vous la décochiez.
- En cours de session, un changement vaut pour la suite : « S'applique aux prochains messages. »
- L'en-tête de la session rappelle les sources actives, par exemple « Corpus Emerit · Internet ».
À la première recherche d'une session, Charlie interroge toutes les sources cochées. Sur une question de suivi, il peut relire ce qu'il a déjà trouvé au lieu de relancer une source. La carte de recherche le signale : voir Lire et vérifier une réponse.
2. Corpus Emerit et ses sous-sources
Cliquez sur la pastille « Corpus Emerit » pour choisir où chercher dans la littérature.
- PubMed : la littérature biomédicale.
- HAL : l'archive ouverte française.
- bioRxiv : les prépublications en biologie.
- PMC full text : le texte complet de plus de 7 M d'articles.
PubMed, HAL et bioRxiv s'interrogent ensemble par défaut, sur les résumés. Décochez celles qui ne servent pas votre question.
Sur une question de détail, comme une dose ou un effectif, Charlie peut compléter ces résumés par des passages du texte intégral. La carte de recherche affiche alors le canal « Texte intégral ».
« Aucune » retire le Corpus Emerit de la recherche, si une autre source est cochée. « Toutes » revient aux trois sources de résumés.
PMC full text, pour chercher dans le corps des articles
Cochez « PMC full text » quand l'information se trouve dans le corps d'un article : méthode, dose, effectif, résultat chiffré.
Par exemple : « Quelle dose d'Akkermansia muciniphila a été administrée dans les modèles murins traités par anti-PD-1 ? »
Cette source s'interroge seule pour l'instant. La cocher décoche PubMed, HAL et bioRxiv, et inversement. Le menu le rappelle : « Le full text s'interroge seul pour l'instant. »
Charlie cherche alors des passages plutôt que des résumés. Ses citations renvoient à un passage précis, que vous ouvrez surligné dans le PDF : voir Lire et vérifier une réponse.
3. Mes bibliothèques
Cochez une bibliothèque pour que Charlie réponde à partir de vos documents. La pastille apparaît dès que vous en avez une.
- Une seule bibliothèque prête : un clic sur la pastille la coche, et la pastille prend son nom. Elle est cochée d'office, jusqu'à ce que vous fassiez un autre choix.
- Plusieurs bibliothèques : la pastille ouvre une liste. Choisir une bibliothèque remplace la précédente.
- Mentions de la liste : « En préparation » pour une bibliothèque pas encore prête, qui ne se coche pas, et « partagée » pour celle d'un collègue.
Pour n'interroger que vos documents, cochez votre bibliothèque, puis choisissez « Aucune » dans le menu du Corpus Emerit.
Gardez le Corpus Emerit coché pour confronter vos documents à la littérature.
Depuis la page « Bibliothèques », « Session avec cette bibliothèque » ouvre une session où elle est déjà cochée.
Pour créer et alimenter une bibliothèque, voir Bibliothèques.
4. Internet
Cochez Internet quand l'information se trouve hors des publications : recommandation d'une autorité de santé, statut réglementaire, site d'un organisme.
Par exemple : « Quel est le statut réglementaire du lécanémab en Europe et aux États-Unis ? »
La séquence d'une protéine demande aussi Internet : Charlie la lit dans UniProt ou GenBank.
Les pages utilisées apparaissent dans le panneau Sources, à la rubrique « Sources internet », avec le badge « Web ».
5. Brevets
Cochez Brevets pour chercher dans les brevets européens et internationaux. Cette source est réservée aux offres Premium et Équipe.
Sur l'offre gratuite, la pastille porte une couronne et mène aux offres.
Charlie vous propose d'abord une requête, que vous validez ou ajustez avant de lancer la recherche. Brevets détaille ce déroulé.
6. Ce qui se combine
Cochez plusieurs sources : Charlie les interroge pour la même question, et chacune a sa carte de recherche. Trois combinaisons sont exclues.
| Sources | Ensemble ? | Ce qui se passe |
|---|---|---|
| Corpus Emerit + Internet | Oui | Les deux sont interrogés. |
| Corpus Emerit + une bibliothèque | Oui | Les deux sont interrogés. |
| Une bibliothèque + Internet | Oui | Les deux sont interrogés. |
| Corpus Emerit ou Internet + Brevets | Oui | La requête de brevets se valide d'abord. |
| PMC full text + Internet ou une bibliothèque | Oui | L'exclusivité de PMC full text ne joue qu'à l'intérieur du corpus. |
| PMC full text + PubMed, HAL ou bioRxiv | Non | Cocher l'un décoche l'autre. |
| Deux bibliothèques | Non | La seconde remplace la première. |
| Brevets + une bibliothèque | Non | Cocher l'un décoche l'autre, avec un message. |
Les deux messages possibles entre Brevets et bibliothèque : « Les brevets ne s'interrogent pas depuis une bibliothèque : elle a été décochée. » et « Une bibliothèque ne s'interroge pas avec les brevets : « Brevets » a été décoché. »
7. Les filtres
Ouvrez les filtres avec l'icône de réglages, à droite du micro : la fenêtre « Paramètres » s'affiche.
- Période : déplacez le curseur ou saisissez les années.
- « Nombre de fois cité (minimum) » : écartez les articles peu cités.
- « Type d'article » : essai contrôlé randomisé, revue, étude comparative, par exemple.
- « Langue » : la langue de publication.
« Valider » applique votre choix. « Réinitialiser » efface les filtres et remet les sous-sources par défaut. Un chiffre sur l'icône indique le nombre de filtres actifs.
L'icône n'apparaît que si le Corpus Emerit est coché, et jamais dans une session de brevets.
Les filtres valent aussi pour PMC full text. Une période y écarte les articles dont l'année est inconnue.
Dès qu'une question part avec des filtres ou une sélection de sous-sources, ces réglages sont figés pour la session. La fenêtre affiche alors « Filtres déjà utilisés pour cette session ». Pour les changer, ouvrez une nouvelle session.
Pour revoir les filtres d'une réponse, utilisez l'icône « Filtres » sous celle-ci : voir Lire et vérifier une réponse.
8. Quand choisir quoi
Partez de ce que vous cherchez.
| Vous cherchez | Cochez |
|---|---|
| L'état des connaissances sur un sujet | Corpus Emerit |
| Une dose, une méthode ou un effectif dans le corps d'un article | Corpus Emerit, avec PMC full text |
| Ce que disent vos propres documents | Votre bibliothèque, avec le Corpus Emerit sur « Aucune » |
| Vos documents face à la littérature | Votre bibliothèque et Corpus Emerit |
| Une recommandation officielle ou un statut réglementaire | Internet, avec ou sans Corpus Emerit |
| Les dépôts sur une cible ou d'un déposant | Brevets |
| L'état de l'art et les dépôts sur une même cible | Corpus Emerit et Brevets |
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