Schema’s en diagrammen — een mechanisme in beeld brengen
Vraag Charlie om een signaalwegschema, een tijdlijn van onderzoeken of een conceptkaart: het genereert direct in het gesprek een Mermaid-diagram, voorzien van bronvermeldingen.
TeamEmerit Science
Charlie genereert standaard diagrammen in Mermaid-formaat, die direct in het gesprek worden weergegeven. U stelt uw vraag in natuurlijke taal — Charlie genereert de Mermaid-code en geeft deze direct weer als interactief diagram, zonder dat u deze naar een externe editor hoeft te kopiëren en te plakken.
En aangezien het schema het resultaat is van wetenschappelijk onderzoek (PubMed, bioRxiv, HAL…), vindt u direct daaronder de bronvermeldingen die elke rand of elk knooppunt onderbouwen.
1. Welke soorten diagrammen?
Stroomdiagrammen & signaalpaden
Signaalketens, reguleringsmechanismen, klinische beslissingsbomen, experimentele workflows.
Tijdlijnen
Chronologische overzicht van belangrijke publicaties over een bepaald onderwerp, fasen van een klinische studie, geschiedenis van een ontdekking.
Mindmaps
Conceptkaart van een domein, categoriehiërarchie, gestructureerde brainstorm.
Sequenties & interacties
Sequentiediagrammen om moleculaire interacties, protocolmatige interacties en reactiestappen te beschrijven.
2. Hoe moet het verzoek worden geformuleerd?
Je hoeft geen syntaxis te leren. Vraag het gewoon in het Frans, net zoals je dat bij een collega zou doen. Een paar zinnen die goed werken:
→ „Maak eens een schema van de p53/MDM2-route met de belangrijkste transcriptiedoelwitten.”
→ „Maak een tijdlijn van de belangrijkste publicaties over KRAS-remmers sinds 2013.“
→ „Maak een mindmap van de mechanismen van resistentie tegen chemotherapie bij triple-negatieve borstkanker.“
→ „Geef me een sequentiediagram van de activering van de JAK-STAT-route na binding van IL-6.”
3. Interactieve viewer en bewerking
- 1 Het diagram wordt direct in het antwoord weergegeven. Klik erop om de viewer op volledig scherm te openen.
- 2 In de viewer: inzoomen, verschuiven, exporteren naar PNG/SVG. Handig om het schema in een presentatie of manuscript op te nemen.
- 3 Ga naar de bewerkingsmodus om een label aan te passen, een knooppunt toe te voegen of de positie te wijzigen — je ziet de Mermaid-code aan de linkerkant en de weergave aan de rechterkant, in realtime.
- 4 Je kunt Charlie ook vragen om het schema in gewone taal te bewerken: „voeg een pijl toe tussen p53 en BAX”, „maak MDM2 rood”.
4. Ondersteunende citaten
Onder het diagram geeft Charlie een overzicht van de wetenschappelijke bronnen die zijn gebruikt om het diagram op te stellen. U kunt de verbindingen in de grafiek valideren door op de citaten te klikken — handig om te controleren of een in het schema beschreven regulering daadwerkelijk in de literatuur is terug te vinden.
Tip
Geef bij signaalwegdiagrammen de context aan („triple-negatieve borstkanker“, „pancreascel“): Charlie beperkt het bereik en het diagram blijft overzichtelijk. Zonder context loopt u het risico een uitputtend diagram te krijgen dat moeilijk te gebruiken is.
En hoe zit het met de statistische grafieken?
De bio-informatische grafieken (PCA, Volcano, UMAP, QC-boxplots) worden gegenereerd in de Bioinfo-module, die nu al in voorvertoning beschikbaar is. Vraag via de app een proefversie aan om deel te nemen aan de bètaversie.
Vraag uw eerste schema aan
Ga gratis aan de slag met Charlie en maak al tijdens de eerste sessie uw eerste wetenschappelijke diagrammen.
Gratis beginnenGerelateerde artikelen
Beeld- en figuuranalyse
Omgekeerd: stuur een schema of een afbeelding naar Charlie, zodat hij deze kan interpreteren.
7 Toepassingen van Charlie
Ontdek de andere overkoepelende vaardigheden van de medewerker (reflectie, kennis delen, bronnen).
Gebruikershandleiding voor Charlie
De algemene handleiding om aan de slag te gaan met de wetenschappelijke AI-agent.