Skjemaer og diagrammer — visualisere en mekanisme
Be Charlie om et signalveiskart, en tidsplan for studier eller et konseptkart: den genererer et Mermaid-diagram som vises direkte i samtalen, med kildehenvisninger.
Emerit Science-laget
Charlie genererer diagrammer i Mermaid-format direkte i samtalen. Du stiller spørsmålet på naturlig språk — Charlie genererer Mermaid-koden og viser den umiddelbart som et interaktivt diagram, uten at du trenger å kopiere og lime inn i et eksternt redigeringsprogram.
Og siden diagrammet er et resultat av vitenskapelig forskning (PubMed, bioRxiv, HAL…), finner du referansene som underbygger hver kant eller hvert knutepunkt rett under.
1. Hvilke typer diagrammer?
Flytskjemaer og signalveier
Signalkjeder, reguleringsmekanismer, kliniske beslutningstrær, eksperimentelle arbeidsflyter.
Tidslinjer
Tidslinje over viktige publikasjoner om et emne, faser i en klinisk studie, historien bak en oppdagelse.
Tankekart
Konseptkart for et område, kategorihierarki, strukturert idédugnad.
Sekvenser og interaksjoner
Sekvensdiagrammer for å beskrive molekylære interaksjoner, protokollære dialoger og trinn i en reaksjon.
2. Hvordan formulere forespørselen
Ingen syntaks å lære. Spør på fransk, akkurat som du ville gjort til en kollega. Her er noen uttrykk som fungerer godt:
→ «Lag et skjema over p53/MDM2-signalveien med de viktigste transkripsjonsmålene.»
→ «Lag en tidslinje over de viktigste publikasjonene om KRAS-hemmere siden 2013.»
→ «Lag et tankekart over mekanismene for resistens mot cellegift ved trippel-negativ brystkreft.»
→ «Gi meg et sekvensdiagram over aktiveringen av JAK-STAT-signalveien etter binding av IL-6.»
3. Interaktiv visning og redigering
- 1 Diagrammet vises direkte i svaret. Klikk på det for å åpne visningsprogrammet i fullskjerm.
- 2 I visningsprogrammet: zoom, flytting, eksport til PNG/SVG. Praktisk når du skal sette inn diagrammet i en presentasjon eller et manuskript.
- 3 Gå til redigeringsmodus for å endre en tekst, legge til et knutepunkt eller flytte noe – du ser Mermaid-koden til venstre og resultatet til høyre, i sanntid.
- 4 Du kan også be Charlie om å redigere diagrammet ved å bruke naturlig språk: «legg til en pil mellom p53 og BAX», «marker MDM2 med rødt».
4. Støttende sitater
Under diagrammet viser Charlie en liste over de vitenskapelige referansene som er brukt til å lage det. Du kan bekrefte kantene i grafen ved å klikke på referansene – dette er nyttig for å forsikre seg om at en regulering som er beskrevet i diagrammet, faktisk har sin kilde i litteraturen.
Tips
Når det gjelder signalveiskjemaer, bør du spesifisere konteksten («trippel-negativ brystkreft», «bukspyttkjertelcelle»): Charlie begrenser omfanget, og diagrammet forblir oversiktlig. Uten kontekst risikerer du å ende opp med et altomfattende skjema som er vanskelig å bruke.
Og hva med statistiske grafer?
Bioinformatiske diagrammer (PCA, Volcano, UMAP, QC-boksplott) genereres i Bioinfo-modulen, som er tilgjengelig i forhåndsversjon. Be om en prøveversjon fra appen for å bli med i betaversjonen.
Be om ditt første skjema
Kom i gang gratis med Charlie og lag dine første vitenskapelige diagrammer allerede fra første økt.
Kom i gang gratisRelaterte artikler
Bilde- og figuranalyse
Omvendt: Send et diagram eller en tegning til Charlie, så han kan tolke det.
7 bruksområder forCharlie
Oppdag de andre tverrfaglige ferdighetene til medarbeideren (refleksjon, deling, kilder).
Brukerveiledning for Charlie
En generell veiledning for å komme i gang med den vitenskapelige AI-agenten.