Scheman och diagram – visualisera en mekanism
Be Charlie om ett signalvägsdiagram, en tidsplan för studierna eller en konceptkarta: den genererar ett Mermaid-diagram som visas direkt i konversationen, komplett med källhänvisningar.
Emerit Science-laget
Charlie genererar diagram i Mermaid-format direkt i konversationen. Du ställer en fråga på naturligt språk – Charlie skapar Mermaid-koden och visar den direkt som ett interaktivt diagram, utan att du behöver kopiera och klistra in i en extern redigerare.
Eftersom diagrammet är resultatet av vetenskaplig forskning (PubMed, bioRxiv, HAL…) hittar du de referenser som ligger till grund för varje kant eller nod precis nedanför.
1. Vilka typer av diagram?
Flödesscheman och signalvägar
Signalkedjor, regleringsmekanismer, kliniska beslutsträd, experimentella arbetsflöden.
Tidslinjer
En tidslinje över viktiga publikationer inom ett ämne, faserna i en klinisk prövning, historiken bakom en upptäckt.
Mindmaps
Konceptkarta för ett område, kategorihierarki, strukturerad brainstorming.
Sekvenser & interaktioner
Sekvensdiagram för att beskriva molekylära interaktioner, protokollmässiga interaktioner och reaktionssteg.
2. Hur man formulerar ansökan
Ingen syntax att lära sig. Fråga på franska precis som du skulle fråga en kollega. Här är några uttryck som fungerar bra:
→ ”Rita upp ett schema över p53/MDM2-signalvägen med de viktigaste transkriptionella målgenerna.”
→ ”Skapa en tidslinje över de viktigaste publikationerna om KRAS-hämmare sedan 2013.”
→ ”Gör en tankekarta över mekanismerna för resistens mot kemoterapi vid trippelnegativ bröstcancer.”
→ ”Ge mig ett sekvensdiagram över aktiveringen av JAK-STAT-signalvägen efter bindning av IL-6.”
3. Interaktiv visning och redigering
- 1 Diagrammet visas direkt i svaret. Klicka på det för att öppna visningsprogrammet i helskärmsläge.
- 2 I visningsprogrammet: zooma, flytta, exportera till PNG/SVG. Praktiskt för att infoga schemat i en presentation eller ett manus.
- 3 Gå till redigeringsläget för att ändra en etikett, lägga till en nod eller flytta om – du ser Mermaid-koden till vänster och resultatet till höger, i realtid.
- 4 Du kan också be Charlie att redigera diagrammet med naturligt språk: ”lägg till en pil mellan p53 och BAX”, ”markera MDM2 med rött”.
4. Källhänvisningar
Under diagrammet listar Charlie de vetenskapliga källor som använts för att skapa det. Du kan verifiera grafens förbindelser genom att klicka på källhänvisningarna – vilket är användbart för att säkerställa att en reglering som beskrivs i schemat verkligen har sin grund i litteraturen.
Tips
När det gäller signaleringsscheman bör du ange sammanhanget (”trippelnegativ bröstcancer”, ”bukspottkörtelcell”): Charlie begränsar omfattningen och diagrammet förblir lättläst. Utan sammanhang riskerar du att få ett alltför omfattande schema som är svårt att använda.
Och statistiska diagram då?
Bioinformatikdiagrammen (PCA, Volcano, UMAP, QC-boxplots) genereras i Bioinfo-modulen, som nu finns tillgänglig i förhandsversion. Begär en testversion via appen för att delta i betatestningen.
Begär ditt första diagram
Kom igång gratis med Charlie och skapa dina första vetenskapliga diagram redan under det första tillfället.
Kom igång gratisRelaterade artiklar
Bild- och figuranalys
Omvänt: skicka ett diagram eller en bild till Charlie så att han kan tolka det.
7 användningsfall förCharlie
Upptäck medarbetarens övriga övergripande kompetenser (reflektion, kunskapsdelning, källor).
Användarhandbok för Charlie
En allmän guide för att komma igång med den vetenskapliga AI-agenten.