Integración de eLabFTW con Charlie: la IA al servicio de su cuaderno de laboratorio

La documentación científica es fundamental en la investigación moderna, pero también supone un gran reto para los investigadores. Entre llevar un cuaderno de laboratorio riguroso y analizar la bibliografía existente, el tiempo dedicado a estas tareas administrativas puede restar tiempo al trabajo de investigación propiamente dicho.

En este contexto, Emerit Scienceanuncia la integración deCharlie , su agente científico de IA, con eLabFTW, el cuaderno de laboratorio electrónico (ELN) de código abierto más popular de Europa. Esta integración promete revolucionar la forma en que los investigadores documentan, analizan y valorizan sus experimentos.

eLabFTW (electronic Lab notebook For The World) es un cuaderno de laboratorio electrónico gratuito y de código abierto, desarrollado bajo licencia AGPLv3. Lanzado en 2012, hoy en día lo utilizan cientos de laboratorios de todo el mundo, desde startups biotecnológicas hasta institutos de investigación públicos.

La herramienta combina varias funciones esenciales:

• Cuaderno de laboratorio electrónico: Registro de experimentos con marca de tiempo, firmas digitales y conformidad con los estándares de trazabilidad científica.
• Gestión de inventario: Seguimiento de recursos (compuestos químicos, plásmidos, anticuerpos, líneas celulares)
• Sistema de reservas: planificación del uso compartido de equipos y recursos entre equipos
• Permisos granulares: control preciso sobre quién puede ver o modificar los contenidos.
• Exportación en múltiples formatos: PDF, ZIP, CSV, JSON y formato ELN estandarizado.

La integración entre Charlie y eLabFTW se realiza de forma transparente a través de la APIe RESTful de eLabFTW. Charlie puede acceder a sus experimentos, protocolos y datos directamente desde su instancia de eLabFTW, respetando los permisos que haya configurado.

Estas son las características clave de esta integración:

Cuando documentas una nueva experiencia en eLabFTW, Charlie puede automáticamente:

• Buscar bibliografía relevante sobrePubMed y PubMed Central
• Identifique las patentes relacionadas con su protocolo en Espacenet.
• Sugerir artículos relacionados y metodologías alternativas.
• Añadir referencias bibliográficas formateadas directamente en su entrada eLabFTW

Esta función convierte su cuaderno de laboratorio en una herramienta de vigilancia científica activa, que contextualiza automáticamente cada experimento en el estado actual de la técnica.

Charlie puede analizar los resultados de sus experimentos y ayudarle a:

• Interpretar los datos: Identificar tendencias, anomalías o patrones en sus resultados.
• Comparar con la bibliografía: Comparar sus observaciones con lo que se ha publicado.
• Proponer experiencias de seguimiento: sugerir controles o variaciones experimentales basadas en sus resultados.
• Generar resúmenes: cree automáticamente resúmenes de sus experiencias para informes o publicaciones.

Encontrar una experiencia específica en años de archivos puede llevar mucho tiempo. Con Charlie, puede consultar su cuaderno de laboratorio en lenguaje natural:

Charlie Comprende el contexto científico de sus consultas y puede cruzar la información de múltiples experimentos para proporcionarle una visión general.

Contexto: Una estudiante de doctorado en biología molecular documenta en eLabFTW una serie de fallos en la PCR cuantitativa.

Acción de Charlie:

• Analiza las condiciones experimentales documentadas (temperaturas, concentraciones, cebadores).
• Busca en PubMed artículos recientes sobre problemas comunes de qPCR.
• Identifica una publicación que sugiere un cambio en la temperatura de hibridación para secuencias ricas en GC.
• Propone automáticamente esta modificación en la entrada eLabFTW con la referencia asociada.

Resultado: ahorro de varios días de resolución de problemas y acceso inmediato a las mejores prácticas publicadas.

Contexto: Un posdoctorado debe redactar la sección «Materiales y métodos» de un artículo científico.

Acción de Charlie:

• Recupera todas las experiencias relacionadas con el proyecto desde eLabFTW.
• Identifica los protocolos y metodologías utilizados.
• Genera un primer borrador de la sección Materiales y métodos en formato académico.
• Añade las referencias de los kits, reactivos y equipos utilizados.

Resultado: reducción del tiempo de redacción de varias horas a unos pocos minutos, con documentación completa y trazable.

Contexto: Un laboratorio del CNRS desea registrar una patente sobre una nueva técnica de purificación de proteínas.

Acción de Charlie:

• Analiza las experiencias de desarrollo de la técnica en eLabFTW.
• Buscar en Espacenet las patentes existentes que cubren métodos similares.
• Identifica los elementos novedosos con respecto al estado de la técnica.
• Genera un informe de vigilancia de patentes para acompañar la solicitud de registro.

Resultado: Evaluación rápida del panorama de patentes y preparación sólida del expediente de propiedad intelectual.

Una de las principales ventajas de esta integración es la soberanía digital que garantiza. A diferencia de las soluciones estadounidenses, que transfieren sus datos fuera de la Unión Europea, la integración eLabFTW x Charlie cumple totalmente con el RGPD:

• eLabFTW se aloja en sus propios servidores o en una infraestructura europea (a través de Deltablot).
• Charlie está alojado en Francia, en un proveedor europeo de servicios en la nube.
• No se transfieren datos a Estados Unidos ni fuera de la UE.
• Cumplimiento total de los requisitos de las instituciones públicas francesas (CNRS, INSERM, universidades).

La implementación de la integración eLabFTW x Charlie es sencilla y no requiere conocimientos técnicos avanzados:

Paso 1: Generar una clave «API» en eLabFTW

En su instancia eLabFTW, acceda a su perfil de usuario y genere una nueva clave API. Esta clave permitirá a Charlie acceder a sus experiencias respetando sus permisos.

Paso 2: Configurar la integración en Charlie

En la interfaz de Charlie , añada su instancia eLabFTW proporcionando:

• La URL de su instancia eLabFTW (por ejemplo: https://lab.example.com)
• Su claveAPI

Paso 3: Defina sus preferencias

Elija las funciones que desea activar:

• Enriquecimiento automático de las experiencias
• Análisis de resultados bajo demanda
• Búsqueda conversacional en el cuaderno de laboratorio

Ahorro considerable de tiempo

Las tareas de documentación, vigilancia bibliográfica y análisis de resultados pueden representar hasta el 30 % del tiempo de trabajo de un investigador. Con la integración de eLabFTW x Charlie , este tiempo se reduce considerablemente, lo que permite centrarse en la experimentación y la innovación.

Mejora de la calidad y la trazabilidad

La contextualización automática de los experimentos y la adición de referencias relevantes enriquecen su cuaderno de laboratorio. Cada experimento se convierte en un documento científico completo, rastreable y referenciado.

Facilitación de la colaboración

Los resúmenes generados por Charlie permiten a los miembros del equipo comprender rápidamente el historial de un proyecto, incluso si no han participado en las experiencias iniciales. Se acelera la transferencia de conocimientos.

Preparación de publicaciones facilitada

La generación automática de secciones de Materiales y Métodos, resúmenes de experimentos y listas de referencias bibliográficas acelera significativamente la redacción de artículos científicos.

La integración de eLabFTW x Charlie es solo el principio. Emerit Science está trabajando activamente en nuevas funciones:

• Análisis predictivo: sugerir experiencias de seguimiento basadas en el aprendizaje automático de sus resultados anteriores.
• Integración con otras herramientas: conexión con GraphPad Prism, ImageJ y otros programas de análisis de datos.
• Plantillas inteligentes: generación automática de protocolos optimizados basados en la bibliografía reciente.
• Detección de anomalías: Identificación automática de resultados aberrantes o que requieren especial atención.

La integración entre eLabFTW y Charlie ilustra una visión de la investigación científica en la que la inteligencia artificial no sustituye al investigador, sino que le ayuda en sus tareas más laboriosas. Al combinar la rigurosidad de la documentación electrónica con la potencia analítica de la IA, esta integración allana el camino para una investigación más eficaz, mejor documentada y más colaborativa.

Para los laboratorios europeos preocupados por su soberanía digital y el cumplimiento del RGPD, esta solución 100 % europea representa una alternativa creíble a las ofertas estadounidenses. El futuro de la investigación científica pasa por herramientas abiertas, soberanas e inteligentes.